Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3cQ80U95 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ube3cQ80U95 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms