Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Avl9Q80U56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms