Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcph1Q7TT79 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms