Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ppp6r1Q7TSI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms