Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms