Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1cQ7TSF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms