Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms