Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmc3Q7TQ69 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmc3Q7TQ69 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc3Q7TQ69 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc3Q7TQ69 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms