Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HhipQ7TN16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms