Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf139Q7TMV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.9 ms