Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp16Q7TMM8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp16Q7TMM8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp16Q7TMM8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms