Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ScocQ78YZ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms