Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim12Q78RX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms