Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6dQ76KF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6dQ76KF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms