Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv1Q704Y3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms