Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2d2bQ6ZWY6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms