Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms