Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl3Q6W5C0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms