Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rhox8Q6VSS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
Rhox8Q6VSS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Rhox8Q6VSS7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rhox8Q6VSS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms