Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4aQ6Q473 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clca4aQ6Q473 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms