Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdf1Q6PIX5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms