Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a2Q6PIE5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp1a2Q6PIE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms