Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54bQ6PFE3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad54bQ6PFE3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms