Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtifQ6PEE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtifQ6PEE2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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