Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PdgfrlQ6PE55 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfrlQ6PE55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms