Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1cQ6PDZ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms