Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms