Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sarm1Q6PDS3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms