Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim37Q6PCX9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms