Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkab2Q6PAM0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Prkab2Q6PAM0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prkab2Q6PAM0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkab2Q6PAM0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms