Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb4Q6P8W9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms