Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa4Q6P8K8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa4Q6P8K8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms