Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W2

Shkbp1, SH3KBP1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shkbp1Q6P7W2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shkbp1Q6P7W2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shkbp1Q6P7W2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms