Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Senp6Q6P7W0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Senp6Q6P7W0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp6Q6P7W0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms