Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc148Q6P5U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms