Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NesQ6P5H2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NesQ6P5H2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms