Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik3Q6P4S6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms