Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm2bQ6P1G2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2bQ6P1G2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms