Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt2Q6NVG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt2Q6NVG7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms