Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf6Q6NVF9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpsf6Q6NVF9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms