Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CltbQ6IRU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CltbQ6IRU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms