Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt39Q6IFX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms