Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nckap5lQ6GQX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nckap5lQ6GQX2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms