Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9bQ6EBV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms