Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Smarca2Q6DIC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca2Q6DIC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Smarca2Q6DIC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms