Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swap70Q6A028 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swap70Q6A028 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms