Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprcapQ64697 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprcapQ64697 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms