Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e1Q64104 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr2e1Q64104 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e1Q64104 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms