Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp248Q640N4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms