Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col4a5Q63ZW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms